MySQL数据库管理系统提供了许多命令行工具，这些工具可以用来管理MySQL服务器、对数据库进行访问控制、管理MySQL用户以及数据库以及数据库备份和恢复工具等。MySQL提供图形化的管理工具，对数据库的操作更加简单。
- MySQL命令行实用程序
MySQL服务器端实用工具程序如下：
（1） mysqld：SQL后台程序（MySQL服务器进程）。必须在该程序运行之后，客户端才能通过连接服务器来访问数据库。
（2）mysqld_safe：服务器启动脚本。在Unix和netware中推荐使用mysqld_safe来启动mysqld服务器。mysqld_safe增加了一些安全特性，如当出现错误时重启服务器并向错误日志文件写入运行时间信息。
（3）mysql.server：服务器启动脚本。该脚本用于使用包含为特定级别的、运行启动服务的脚本的、运行目录的系统。它调用mysqld_safe来启动MySQL服务器。
（4）mysql_multi：服务器启动脚本，可以启动或停止系统上安装的多个服务器。
（5）myisamchk：用来描述、检查、优化和维护MyISAM表的实用工具。
（6）mysqlbug：MySQL缺陷报告脚本。它可以用来向MySQL邮件系统发送缺陷报告。 （7）mysql_install_db：该脚本用默认权限创建MySQL授权表。通常只是在系统上首次安装MySQL时执行一次。
MySQL客户端使用工具程序如下：
（1）myisampack：压缩MyISAM表，以产生更小的只读表的一个工具。
（2）mysql：交互式输入SQL语句或从文件以批处理模式执行他们的命令行工具。
（3）MySQLaccess：检查访问主机名、用户名和数据库组合的权限的脚本。
（4）MySQLadmin：执行管理操作的客户程序，如创建或删除数据库、重载授权表、将表刷新到硬盘上以及重新打开日志文件，MySQLadmin还可以用来检索版本、进程，以及服务器的状态信息。
（5）MySQLbinlog：从二进制日志读取语句的工具。在二进制日志文件中包含执行过的语句，可用来帮助系统从崩溃中恢复。
（6）MySQLcheck：检查、修复、分析以及优化表的表维护客户程序。
（7）mysqldump：将MySQL数据库转储到一个文件（日SQL语句或tab分隔符文本文件）的客户程序。
（8）mysqlhotcopy：当服务器在运行时，快速备份MyISAM或萨满表的工具
（9）mysqlimport：使用LOAD DATA INFINLE将文本文件导入相关表的客户程序。
（10）MySQLshow：显示数据库、表、列以及索引相关信息的客户程序。
（11）perror：显示系统或MySQL错误代码含义的工具。
- MySQL Workbench
MySQL Workbench是下一代可视化数据库设计软件，为数据库管理员和开发人员提供了一整套可视化数据库操作环境，主要功能有：
- 数据库设计和模型建立
- SQL开发
- 数据库管理
MySQL workbench有两个版本：
（1）MySQL Workbench Community Edition（也叫MySQL workbench oss，社区版），是在GPL证书下发布的开源社区版本。
（2）MySQL Workbench Standard Edition（也叫MySQL Workbench SE，商业版），是按年收费的商业版本。