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第一性原理计算服务器如何选?

第一性原理是什么?

根据原子核和电子相互作用的原理及其基本运动规律,运用量子力学原理,从具体要求出发,经过一些近似处理后直接求解薛定谔方程的算法,习惯上称为第一性原理。

第一性原理计算方法即从头算(ab initio)被广泛应用在化学、物理、生命科学和材料学等领域。它的基本思想是将多个原子构成的体系看成是由多个电子和原子核组成的系统,并根据量子力学的基本原理对问题进行最大限度的“非经验性”处理。它只需要5个基本常数(m0,e,h,c,kB)就可以计算出体系的能量和电子结构等物理性质。

第一性原理计算的理论基础和实现方法:绝热近似、密度泛函理论(DFT)、局域密度近似(LDA)和广义梯度近似(GGA)、平面波及势方法、密度泛函的微扰理论等。

第一性原理计算方法的常用软件有VASP MS,G.ussin Wien2K ATK Siesta等,这些软件计算量一般都非常巨大,都需要强大的高性能计算服务器,甚至是高性能计算集群的支持。第一性原理计算速度主要依赖于CPU核心数、CPU主频、内存容量、内存带宽等因素,如果采用高性能计算集群来做第一性原理计算的话,那么节点与节点之间通信的网终带宽也对计算速度有较大影响。合适的的型,合理的配置才能发挥最大效益。

第一性原理计算服务器分为静音塔式服务器和机架式服务器两种,静音塔式服务器可以放置在办公室像合式机一样使用,机架式服务器可以放置在机房远程使用,用户使用起来非常方便,目前可以分为ntel平台方案和MD平台方案。基于Intel Xeon CPU平台方案最大支持四路CPU,CPU核心高达112个,最大支持48根内存通道,内存容量高达12TB。基于AMD EPY CPU平台方案最大支持双路CPU,CPU核心高达192个,最大支持32根内存通道,内存容量高达8TB。CPU计算能力强劲,内存带宽和容量都非常大,可以加快完成客户的第一性原理计算任务。

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