对U盘是有一定影响。
主要是降低U盘的使用寿命。但是，如果用系统自带的格式化，也就是修改了文件的标头，使系统认不出。这种格式化是可以的。对它的损坏小。
可以彻底清除U盘里面的数据，可以理解不可恢复，一般情况下不采用U盘低级格式化，低级格式化后扇区清零，需要重新写入校验值，恢复到初始值。同时重新写入扇区的标识值，所以低级格式化对U盘有一定危险。比如，U盘质量不怎么好的话会出现拒绝读写操作。因此，随意进行低级格式化是很危险的一个事情，低级格式化造成的数据丢失恢复难度非常大，非专业人士是无法恢复的。
低级格式化u盘步骤:
1、点击开始菜单-分区工具-硬盘低格工具。
2、在弹出的许可协议上点击“同意”打开硬盘低格工具窗口。
3、接着在选择设备窗口中，点击选择需要低格的硬盘，并点击“继续”按钮。
4、在弹出的窗口中，点击“低级格式化”项，然后点击“格式化这个设备”。
5、在弹出的警告窗口中，点击“是”开始低格硬盘操作。
将U盘插入USB接口，下载驱动精灵对U盘的驱动程序进行修复，即可显示盘符，然后点击属性，在属性中选择低级格式化，即刻完成低级格式化。
格式化U盘有很多方法，下面介绍最简单的两种方法：
方法一：使用Windows系统自带的磁盘管理工具
1.将U盘插入电脑。
2.打开“我的电脑”或“此电脑”。
3.找到U盘所在的磁盘，鼠标右击选择“格式化”。
4.在弹出的窗口中可以选择文件系统类型和簇大小等参数，也可以直接点击“开始”进行快速格式化。
5.等待格式化完成后，即可退出磁盘管理工具。
方法二：使用第三方格式化工具
除了使用Windows自带的工具外，还可以使用第三方的格式化工具，例如DiskGenius、EaseUS Partition Master等。
1.下载并安装所需的格式化软件。
2.打开软件，找到U盘所在的磁盘，选中该磁盘。
3.在操作界面中选择“格式化”，填写对应的格式化选项，例如文件系统类型、簇大小等。
4.点击“开始”按钮进行格式化。
5.等待格式化完成后，退出软件即可。
总之，以上两种方法均是格式化U盘的最简单方法。需要注意的是，在格式化U盘前要备份好存储在U盘中的重要数据，否则格式化操作可能会将所有数据清空。